個人住民税を納める市区町村は、1月1日時点で住民票のある市区町村となりますので、仮に、1月2日にA市からB市に引っ越しをされた場合におきましても、同年6月～翌年5月に支払う個人住民税は全額A市に対して支払うことになります。
　また、個人住民税には二つの徴収方法があります。

　特別徴収
　役員・従業員の給料から天引きする所得税と同様に、会社(個人事業主)が各従業員の毎月の給料から個人住民税を年額の1/12ずつ預かって、会社(個人事業主)が預かった個人住民税を翌月10日までに各従業員の住所地の各市町村宛てに納付する方法です(実際に納付する場所は、郵便局や銀行といった金融機関です)。

　普通徴収
　会社(個人事業主)は、役員・従業員の給料から本人の個人住民税を天引きせず、役員や従業員ご自身が本人分の個人住民税を年4回(おおむね6月、8月、10月、翌年1月の末日)1/4ずつ、お住まいの市区町村宛てに納付する方法です(実際に納付する場所は、郵便局や銀行といった金融機関です)。

　会社(個人事業主)にとって、手間がかからないのは当然普通徴収です。
　しかし、市区町村は個人住民税の徴収率を上げるため(各個人に個人住民税を請求しても、支払わない人が多い)、特別徴収を推進しています。
　当事務所としたしましては、会社(個人事業主)における事務の簡素化のため、基本的には普通徴収を選択していましたが、今後につきましては、強制的に特別徴収になる見込みです。
　実際、埼玉県は平成27年度から、千葉県と神奈川県は平成28年度から、東京都は平成29年度から個人住民税の特別徴収が強制になりました(ただし、一部例外がございます)。

　また、以下の基準を満たせば、当面の間、個人住民税の普通徴収も認められます。
　その場合には、当事務所が給与支払報告書の提出時(下の図の①です)に「普通徴収切替理由書」も添付しなくてはいけませんので、ご希望の方はおっしゃって下さい。

　総従業員(役員を含む)が2人以下の事業所(ただし、他の勤務先で特別徴収されている方や、住民税が非課税の方は除く)

特別徴収の流れ

　下の図では、役員・従業員がお住まいの市区町村が「右の四角」、会社(個人事業主)が「真ん中の四角」、役員・従業員が「左の四角」となります。
 

1. 　5月31日までに各従業員がお住まいの市区町村から会社(個人事業主)に対して、個人住民税の納付書が届きます。個人住民税は、前年の年収等に基づき課せられます。下の図では、②に該当します。
    
2. 　 会社(個人事業主)は6月～翌年5月までの毎月に渡り、各従業員に給与を支払う際に、本人の個人住民税を差し引きます。下の図では、③になります。また、差し引く金額は、下の②で送付されてきた資料に記載されています。
    
3. 　各従業員の給与から差し引かれた個人住民税は、会社(個人事業主)が翌月10日までに郵便局や銀行等といった金融機関の窓口でお支払することになります。下の図では、④に該当します。